心灵终结全剧情
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第二次世界大战
第二次世界大战是一场1946年发起的武装冲突，苏维埃联盟发动了许多侵略战役来实现约瑟夫·斯大林的梦想:一个从大西洋海岸延伸到太平洋海岸的共产主义联盟。反抗他们的是盟军，抵抗苏联对任何世界大国的侵略，并维护世界国家协会规章的军事联盟。多亏了盟军指挥官的高超技术，苏联的入侵被阻止了，形势也转而变为盟军有利。在绝望的防御后，苏维埃的战争机器被粉碎,莫斯科乃至整个苏俄不久后都被盟军占领。
背景
经过第二次世界大战中纳粹德国崛起造成的破坏之后，阿尔伯特·爱因斯坦发展了超时空传送仪来回到过去。他的意图是刺杀阿道夫·希特勒，阻止纳粹党获得权力并引发第二次世界大战。1946年，爱因斯坦回到了1924年，来到了德国的兰茨贝格监狱,希特勒刚服完巴伐利亚啤酒馆政变的刑后被释放。在监狱外面遇见希特勒后，爱因斯坦从时间上抹去了希特勒。然而，在没有第三帝国挑战的情况下，约瑟夫·斯大林统治下的苏联没有受到遏制。斯大林设想了一个全球性的苏维埃联盟，而他自己是每个苏联公民思想和精神的最高统治者。这使得战争不可避免。
苏联侵略性的姿态导致了欧洲领土的变化。西欧列强坚持绥靖政策，同意苏联强加于他们的条件，导致国际上国界发生重大变化。包括波兰在内的几个东欧国家被迫接受苏联在其边界内拥有军事部队和在其政府中有苏联顾问。从本质上说，苏联在不发射一发子弹的情况下殖民了东欧大部分地区。
战争开始时，苏联有一支庞大的军队，征募了1400万名士兵，在警察、民警和其他方面服役的士兵超过700万。它也是一个经济大国，其资产超过4862亿瑞士法郎。它还由一个2亿多名特工组成的庞大网络支持，渗透到大多数泛非、泛印度和泛亚国家的政府中，在墨西哥城和温哥华也有疑似据点。盟军已知的其存在的指挥所包括莫斯科、基辅、斯大林格勒、喀土穆、卡拉奇和岘港。苏联还与世界民主社会、亚洲防卫联盟和自由联盟等国际组织有密切联系。相比之下，盟军力量要弱得多，只有340万士兵，大约170万非正规（游击和反抗）部队。作为一个军事组织，它在三个主要指挥所运作：伦敦联合作战总部、奥斯陆北部战区指挥中心和马德里南部战区指挥中心。
战争记录战争前奏苏维埃的战争始于苏联军队对东亚的侵略。在这次战役中，Marshall Gradenko表现突出，最终升任为斯大林最信赖的将军。Gradenko在入侵欧洲之前的任务之一是对苏联的**神经毒气进行战场测试。原计划要求用**消灭波兰和德国的人民，迫使西方投降。然而，由于盟军间谍网络的努力，加上北欧的一系列军事打击，摧毁了神经毒气生产设施，防止了化学灾难。更悲惨的事件之一是一个在波兰的反抗运动中拿起武器的支队在托伦外被杀害。他们和居住在该地区的所有平民一起，在苏联某指挥官的指挥下被苏联军队击毙。此时，苏联控制了芬兰、斯洛伐克、匈牙利、罗马尼亚、波兰，并作为入侵土耳其、伊拉克的中转站。盟军控制着包括挪威、瑞典和捷克共和国在内的大多数欧洲国家。初期攻势苏联入侵西欧——在边境设立了前哨指挥部标志着袭击德军的准备工作顺利进行中。摧毁托伦的那位苏联指挥官被派去和Georgi Kukov一起守卫河上的桥梁。德国军队铤而走险地袭击了防御良好的苏联阵地并破坏了桥梁。然而，苏联并没有被这些阻止，他们让步兵师穿越河流，在敌人的土地上与他们交战，战役开始了。在德国敌后深处的一次突袭中，苏联俘虏了阿尔伯特·爱因斯坦，他曾提出为盟军开发新武器的计划。盟军迅速做出反应，派遣谭雅·亚当斯前往斯洛伐克-匈牙利边境，带领小型突击队去营救这位科学家。这个基地出乎意料地迅速被攻陷，因为它严重依赖磁暴线圈来防御，却没有对其发电厂提供足够的保护。这主要是因为苏联侵略者修建基地相当匆忙。在苏联军队穿过芬兰来占领挪威和瑞典时，在红军迅速实施海军进攻的瑞典南部，一个盟军间谍渗透并摧毁了一座为数不多的天然气生产设施。Gradenko试图向斯大林隐瞒事实，但Nadia告诉了斯大林并让他注意。指挥官被派去处理间谍。最终，尽管有来自瑞典反抗军和盟军残部的帮助，间谍还是被抓获并杀死。延缓红军前进——苏联军队执行Nadia制定的计划，在柏林附近的德国通信中心交战，迫使盟军分兵来拯救关键的通信节点。这让柏林暴露无遗，苏联迅速占领了这个首都。盟军被迫撤退，战地指挥官A9被命令去控制波兰-捷克斯洛伐克边界苏迪山脉的通道。在资源有限的情况下，他设法摧毁了该地区的敌军，并让盟军车队安全通过。盟军在波兰中部和东部取得了胜利，并防止其被敌人夺回。谭雅·亚当斯被派遣去摧毁波兰苏维埃边界的关键桥梁，这是她完美完成的一项任务。与此同时，苏军入侵保加利亚和土耳其并在斯堪的纳维亚稳步进军。在爱琴海战区，土耳其军队在他们的国家被苏联占领前不顾一切地撤退到伊拉克。尽管谭雅的任务取得了成功，但该计划最终还是失败了，因为苏联军队设法包围并摧毁了在波兰过度扩张的盟军军队，迅速恢复失地，并使得指挥官A9不得不过早地放弃苏迪山脉的山口。面对高地防守，尽管技术有优势，苏联部队还是被击退了。希腊沦陷——为了支援他们对希腊的攻击，苏联指挥部派遣了一支采矿队前往卡尔基斯岛开展行动。他们还去占领盟军雷达球以监视敌人在该地区的活动。在苏联入侵期间，冯·艾斯林将军的助手斯塔夫罗斯将军坚持亲自去看望他的祖国和在雅典郊区的村庄，并深感悲痛。在看望期间，他亲眼目睹了苏联对本国人民犯下的暴行，其中包括以极端方式消灭整个村庄。随着希腊的沦陷，盟军开始从雅典附近的村庄撤离平民，以减少受到苏联的迫害的希腊人。很快，希腊战线坍塌，苏联旗帜在希腊、土耳其、伊拉克、叙利亚和塞浦路斯的首都上空飞扬。同时，苏联在中欧的进攻占领了德国，并进入到法国东部、意大利北部和比荷卢。然而，出现了一项突破，盟国外交官说服了联合国建立特别的军事资金来支持盟军的事业。在281票对7票的投票中，该倡议获得通过，并同意在未公开的欧洲首都成立一个全球防务机构。尽管随着盟军在希腊的前线崩溃前景相当黯淡，联合国的资助计划标志着战争的转折点，尽管在当时看它似乎并不是。特工谭雅·亚当斯，曾经营救爱因斯坦的关键人物，在传送有关苏联最高机密研究项目之一的重要信息的时候被苏联俘虏。为了防止她被运送到莫斯科接受审讯和处决，冯·艾斯林将军派遣了指挥官A9去从格罗德诺附近的苏联监狱设施中救出她。尽管遭受不少折磨，特工谭雅还是逃脱了囚禁(尽管帮助她的间谍在此过程中被杀害)，并向盟国提供了铁幕项目的信息。力挽狂澜获得主动权——由于资金和支持的增加，盟军慢慢开始夺回失去的土地，对苏联处于优势。在挪威，苏联的暴行已经停止。在捷克斯洛伐克、奥地利和匈牙利，盟军成功地保卫了他们的阵地并将苏联赶回。在南斯拉夫，盟军对夺回希腊进行准备。盟军司令部并没有注意到前往波兰西部戈尔佐的护航队的内容，他们正在运输着第一批核武器的部件。与阿尔伯特·爱因斯坦教授协商后，盟军决定从新解放的希腊沿海地区派遣一支突击部队攻击苏联在爱琴海的潜艇基地并兼作研究基地，以防止铁幕的部署。其目标是渗透研究中心以获取项目的信息，然后销毁它们。这次袭击是成功的，盟军阻碍了对这一装置的研究。然而，这对它的部署仅仅只是推迟了。盟军追踪到了丹麦的博恩霍尔姆岛的一份向苏联高级司令部递交的报告。此后不久，一支大型突击部队前往此地占领苏联基地并控制他们的雷达球，以便评估与铁幕计划的关系。在其他战线上，盟军从小亚细亚发动进攻，解放叙利亚和伊拉克。此外，经过迅速的战役，挪威和瑞典大部分地区从苏联手中被解放出来，希腊和塞浦路斯也是如此。超时空传送仪计划——这段时间内，盟军的研究人员都在阿尔伯特·爱因斯坦教授的领导下努力研制一种能够扭转战争的武器。基于爱因斯坦的研究，进行了费城实验来检验为超时空传送仪铺路的理论。它的目的是对超时空效应提供可靠的控制。主要的研究中心位于奥地利的莱克，专注于控制效果。那里的科学家们即将获得重大突破时，苏联领导层获悉这个设施的位置并在一个关键前夕攻击它。A9指挥官巧妙地运用他的部队，保卫了该项目的技术中心，并可能挽救了欧洲的未来。苏联对靠近意大利海岸的埃尔巴岛进行残酷袭击，消灭了所有正在实地测超时空传送仪盟军部队，及帮助反抗的平民，对这项研究造成了一些小挫折。然而，这并没有使盟军停滞不前，他们的进攻开始取得势头。在这个阶段，欧洲大部分地区摆脱了苏联的控制，苏军在东德被围困，巴尔干半岛几乎完全解放，盟军的师团进军土耳其和芬兰。德国的苏联人铤而走险，想劫持人质并提出要求。苏联被迫从进攻作战转变为防御作战。在红色的土地上挫败苏联核攻击——就在那时，苏联高级研究员Vladimir Kosygin希望叛逃到盟军，他联系了冯·艾斯林将军并透露了他的地点。盟军向拉脱维亚苏维埃共和国首都里加派遣了一支小规模的突击部队，他们在那里渗透入敌人的基地并营救Kosygin逃离了研究基地。叛逃者透露了斯大林另一个秘密武器的细节——核弹。冯·艾斯林将军认识到了这一威胁，派遣A9和他的部下去苏联领土深处的乌拉尔山脉，在那里他们袭击了位于核武器研发中心的黑骑兵军事基地。然而，在进攻中他们发现基地还有核弹发射井，尽管很显然盟军可以攻占这个基地，这些核弹仍会对欧洲各首都发射。A9保持冷静，将地面部队的指挥权交给他的一名中尉，并亲自指挥渗透到核弹工厂的小队。在被迅速派来协助的谭雅·亚当斯的帮助下，他设法关闭了四个发射井，防止了核弹攻击欧洲。英国议会外面埋藏的核弹弹头，是盟军在胜利似乎如此接近时，失败又是多么接近的标志性形象。在这场胜利之后，盟军最终消除了苏联在欧洲的最后一部分抵抗，使得苏联得在自己的土地上自卫。盟军入侵苏联——为了提供重型火力支援并率先发起攻击，盟军的一个大支队在伏尔加格勒（斯大林格勒）附近登陆并清除了阻碍军舰沿伏尔加河行驶的瓶颈。在巡洋舰和驱逐舰的支援下，盟军迅速深入敌军领地，海军在战役中发挥了重要作用。然而，在盟军进一步行动之前，他们必须调查关于更强大版本的铁幕即将上线的传言。在新的长弓武装直升机的支援下，欧洲军方在这种装置成为重大威胁前迅速拦截并摧毁了它。在这次任务中占领的科技中心显示，苏联军队有一个主要的地下武器工厂，它很快被一个精英突击队摧毁。这一事件，连同在西伯利亚的摧毁苏联剩余核能力的残酷战役，为进军苏联的首都莫斯科铺平了道路。战争结束——占领了大部分在欧洲的苏联大陆的盟军利用了它的全部军备在这场最后的战斗中攻击莫斯科。谭雅·亚当斯被派去作为进攻的先锋并为盟军的初步部署筹集了资金。当她成功时，大部分盟军远征军到达了。很快，他们建立了一个基地并在一场大规模的血战中打败了最后的苏联卫兵。在战斗中，斯大林受重伤，在袭击中被埋在瓦砾中。这个独裁者是盟军步兵发现的，后来被尼克斯·斯塔夫罗斯发现。斯塔夫罗斯命令步兵抛弃而不是俘虏斯大林。为了为他的祖国希腊复仇，斯塔夫罗斯痛斥斯大林并让这个独裁者等死。————战争终于结束了……后果
随着苏联的失败，盟军成功地捍卫了欧洲的自由，结束了斯大林的暴政。然而，这场胜利伴随着巨大牺牲，估计有1亿人丧生。 战争结束后，美国介入并协助战后重建工作，其中包括任命亚历山大·罗曼诺夫这个前王室的远亲且是个推崇和平的共产主义人士成为国家的新领导人。对于盟军来说，这是一个代价高昂的错误。 此后，罗曼诺夫任命了新的神秘顾问。40年后，他将使苏俄站起来，对盟军进行反击。
细节
红色警戒本打算作为最初的命令与征服的前传(来解释一些更古怪的科技背后的背景)。但是西木发布红色警戒2后就变得不一样了，因为这让红色警戒世界完全成了不同的世界线。 在拉斯维加斯的西木工作室试图通过泰伯利亚入侵和叛逆者2来进行亡羊补牢,但是西木工作室在这些项目开发前就已经关闭了。因此，红色警戒宇宙可以看作与泰伯利亚宇宙是不同的，但是盟军在第一次红色警戒中的结局，是一个可以与泰矿宇宙连接的时间线。
第三次世界大战
第三次世界大战是一场1982年的全球战争，由苏维埃俄罗斯领导，拉丁同盟和中国参与的苏维埃联盟发起了这场战争, 在苏俄创建的以尤里为领袖利用精神控制和操纵来协助战争的心灵部门的支持下，入侵美利坚合众国及欧洲。反抗苏联的同盟国联军是美国、欧洲联盟和太平洋阵线组成的松散军事联盟。
尽管盟军竭尽全力似乎暂时扭转了局势，苏联还是通过使用致命的核武器最终赢得了战争并控制了整个北美洲和欧洲大陆，而不列颠群岛仍然在盟军的掌控下。此外，苏俄成功地打败了试图篡夺苏联领导者的地位的中国/太平洋阵线联盟，而尤里的心灵部门成功地推进了他们自己的目标。
主要事件：入侵美国入侵欧洲太平洋阵线/美国对苏俄的反侵略由天蝎组织在非洲/中东的引起的动乱, 苏联/盟军也参与在内中国与中国叛军之间的战争与动乱, 心灵部门和苏俄也参与在内中国/太平洋阵线联盟入侵苏俄中国/太平洋阵线的前线战争，心灵部门参与在内背景
自从盟军赢得第二次世界大战并杀害约瑟夫·斯大林以来已经过去了四十年。与此同时，盟军已经选举了一位傀儡领袖罗曼诺夫总理（据说是沙皇尼古拉二世的远亲），以保持盟军和苏联之间的关系。虽然这一关系一开始很成功，但是自从一个名叫尤里的神秘男子成为罗曼诺夫的首席顾问后，形势开始急剧下滑。盟军开始在全世界范围内遭受苦难。由于政治压力，盟军被迫撤出苏俄领土内的部队。中国，墨西哥和南美洲的大部分地区都转向了共产主义，而与美国在亚洲情报网络的所有联系都神秘地消失了。
最终在1982年3月8日达到高潮，罗曼诺夫宣布对美国发动战争，大规模苏联部队从太平洋和大西洋同时入侵。除了这些舰队，拉丁同盟还通过墨西哥开始入侵美国边界。美国本可以利用他们最有力的威慑力量，即和平守护者洲际弹道导弹网络，来抵御这些对其海岸和边界的威胁。然而，它在未知情况下被摧毁。(美国并不知道心灵部门的部队渗透到和平守护者的设施中，并从内部摧毁了它。此后特工们很快自杀以避免美国人将证据联系在一起）
当枪声开始横穿西部和东部海岸时，美国军队急切地集结起来保卫华盛顿免受苏联的攻击，他们知道五角大楼和白宫都很脆弱。而在美国东部的其他地方，一位高级苏联将军的任务是摧毁美国军队和占领纽约市。
剧情
第二次世界大战结束后，苏联战败，受到盟军的操控。但是在战争开始前的数年，俄罗斯逐渐壮大并脱离了盟军的掌控。战争开始的十年前（即1972年），伯瑞斯和莫拉莱斯前往东乌克兰的美军实验室，夺回了苏联的半机械英雄沃尔科夫和契特卡伊的躯体（苏联附加任务：原型）。苏俄总理罗曼诺夫的军事顾问尤里使用心灵控制，干涉了盟军在俄罗斯境内的卫星发射中心，用火箭发射了一个特殊装置（厄普西隆合作任务：电视与谎言）。
1982年3月8日，苏联正式向盟军宣战。第三次世界大战爆发。美国虽然想启动和平守卫者导弹进行反击，却遭到了尤里的破坏（厄普西隆01：和平守护者）。苏俄攻入美国境内，虽然美军守住了华盛顿（盟军01：赤色黎明），但纽约和美国西海岸却被苏联攻陷（苏联01：血色蔓延；苏联02：金门之战；苏联合作任务：针尖麦芒）。与此同时，苏俄入侵乌克兰（厄普西隆02：助燃剂），并向欧洲进军。
在谭雅的协助下，美军夺回了科罗拉多的空军基地（盟军02：鹰击长空）。拉丁同盟开始向美国南部出兵，美军运用空军防守住了拉丁同盟的入侵（盟军03：旅途之路）。美军同时防守住了拉丁同盟对洛杉矶的入侵（盟军合作任务：流浪车手），谭雅还协助盟军夺回了佛罗里达州的海军基地（盟军04：天堂与地狱），但拉丁同盟派出莫拉莱斯刺杀了美国总统（苏联03：生日快乐），美军不得不反击拉丁同盟并摧毁了其白磷工厂（盟军合作任务：光辉岁月）。太平洋阵线进攻了俄罗斯本土，但被击退（苏联04：副作用；苏联合作任务：烧尽）。在此期间，尤里偷走了一辆斯大林之拳，将其交给天蝎组织的领导人拉什迪，以开发自己的基地车（厄普西隆03：废料回收）。尤里虽然协助苏俄摧毁巴哈马的美军航母舰队（厄普西隆04：海难），但暗中完成了机动建设车原型（厄普西隆合作任务：反击时刻）。
苏联开始使用心灵控制战术与盟军作战，盟军发现并摧毁了纽约的心灵信标（盟军05：坏苹果）。苏联在圣路易斯和芝加哥同时部署心灵信标，圣路易斯的心灵信标在苏联指挥官的坚守下成功启动（苏联05：和平条约），而在芝加哥更是建造了一个可以扩大心灵控制范围的装置——心灵控制增幅器。美军迅速派出部队摧毁了心灵控制增幅器（盟军06：美丽心灵），但苏俄随后向芝加哥发射了一枚MIDAS洲际导弹，摧毁了大部分美军兵力。
美国已经失去了战斗力，苏联开始把注意力放在欧洲上。沃尔科夫和契特卡伊对巴黎的突袭扰乱了盟军的部署（苏联06：充电器），而拉丁同盟也登陆西班牙（苏联合作任务：反客为主）。苏联和欧洲联盟为争夺港口，展开了数次交战（盟军合作任务：集体战争；苏联合作任务：悔改之时、焦土）。尤里因斯大林之拳失窃案受到怀疑，于是他控制了盟军间谍继续窃取苏军科技以转移嫌疑（厄普西隆05：人盾）。在非洲的美军意外缴获了厄普西隆的机动建设车原型，天蝎组织迅速做出反应，在盟军查明真相前销毁了机动建设车（厄普西隆06：闭锁空间）。为了维护非洲的稳定，盟军派出部队夺回了被苏俄占据的非洲据点（盟军合作任务：执法者）。
为阻止苏俄继续使用洲际导弹，盟军破坏了萨哈林岛的一座采矿设施（盟军07：重锤出击），并摧毁了大部分装载着MIDAS弹头的白杨M（盟军08：危机边缘），还摧毁了中国的核研究设施（盟军合作任务：战争科学）。但两枚MIDAS弹头被尤里事先藏起，因而幸免于难。中国出兵进攻了日本，并开始支援苏俄在欧洲的作战。尤里与中国军方达成协定，以一个心灵信标为代价参与了一支中国部队的进攻，并控制了这支部队获得了日本的科研成果（厄普西隆07：另辟蹊径），中国也袭击了另一处金川工业复合基地（苏联附加任务：星蚀）。与此同时，苏联继续消灭北美洲残余的盟军（苏联07：流言蜚语），并摧毁了命运科技的数个研究设施（苏联合作任务：夜幕降临、雷霆之神；厄普西隆合作任务：呼风唤雨）。
拉丁同盟摧毁了珍珠港的墨丘利卫星上链装置（苏联08：死从天降），而盟军也摧毁了拉丁同盟的自爆吉普车部队（盟军合作任务：进击的飞车）。欧洲联盟向盟军提供了悖论计划来反击苏联。苏俄和中国企图封锁盟军的通信，但是失败了（盟军09：零信号）。随后盟军从被中国占领的日本解救了参与悖论计划的科学家（盟军10：园丁），但由于中国使用EMP干扰，超时空传送发生了故障（苏联合作任务：尔虞我诈），科学家被传送到战场上。盟军不得不保护科学家进入黑森林并摧毁了那里的苏军基地（盟军11：险象环生），但苏俄又在盟军的超时空进攻下发射了一枚MIDAS洲际导弹（苏联09：无果之路），摧毁了德国的盟军，所幸科学家被成功转移。盟军只得放弃德国（盟军合作任务：铁血战场），撤退至英国。
苏联想要使用升级版的天启坦克进攻盟军，但却被盟军渗透而失败（盟军合作任务：疯狂巨兽）。尤里出尔反尔，将借给中国的心灵信标收回，控制了西藏的中国军队（厄普西隆08：保险失效）。西藏心灵信标一事引起了苏俄的注意，苏俄派出沃尔科夫、契特卡伊和一架基洛夫飞艇前去摧毁信标（苏联10：战争狂人），与此同时开始总攻英国，但盟军使用短剑防御系统来抵御洲际导弹，在英吉利海峡全歼了苏联的海军（盟军12：曙光）。拉什迪被苏联抓获，由拉丁同盟关押在关塔那摩监狱中，尤里铤而走险救出拉什迪（厄普西隆09：杀戮刑场）。法国北部的盟军部队选择坚守领土，为盟军在英吉利海峡的反击争取了时间（盟军合作任务：没落之地）。盟军还占领了拉丁同盟的燃烧弹仓库，莫拉莱斯率领小队前去夺回了这些燃烧弹（苏联合作任务：薪火相传）。
苏俄的将军同志为了验证自己的怀疑，登陆了日本鹿儿岛进行调查，到达后却发现鹿儿岛已被中国占领。中国想要破坏地震平衡杆一举消灭苏俄部队并毁灭证据，但遭到阻止（苏联11：不可撼动）。此时，尤里已经遭到了怀疑并离开了克里姆林宫。为了避免苏俄使用洲际导弹报复中国，中国提前渗透了存放最后一枚MIDAS洲际导弹的苏联基地并发动了突袭，尤里想要通过帮助苏联运送白杨M发射台重获信任，却在最后功亏一篑（厄普西隆10：焦点转移）。尤里只能离开苏俄，并趁中俄交战时期删除了心灵部门的军备资料（厄普西隆合作任务：失忆）。中国发动大军进攻滨海边疆区，但以失败告终（苏联12：巨龙风暴）。
为了防止中国和太平洋阵线的联盟继续扩张，拉什迪派出马尔翁协助尤里挑起朝鲜和韩国的战争（厄普西隆11：奇点）。尤里的部队消灭了太平洋阵线的冰雹攻城平台与其护送部队（厄普西隆合作任务：兵贵神速）。最终，尤里集结已经发展壮大的心灵军团，进攻了哈萨克斯坦的火箭发射基地（厄普西隆12：月光），窃取了苏俄的火箭技术，并宣告了厄普西隆军的成立。
心灵终结战争
心灵终结战争是1984年的全球战争, 由重新出现的心灵军团（现在叫厄普西隆军）通过突袭苏维埃联盟的核心苏俄发起。
背景
在第三次世界大战的后期和结束阶段，盟军和苏联都经历了许多失败和成功，包括一些意想不到的事件。
在征服了欧洲大部分地区并摧毁黑森林之后，苏联打算通过一次大规模的海军入侵英国来完成他们的征服，但是由于盟军防御者的坚定决心而失败了。这为盟军赢得了恢复力量的时间。
与此同时，在苏联方面事情进展得并不顺利。中国西藏的心灵信标发生了一些变故，迫使苏俄自己去摧毁它来将他的中国盟友从心灵控制带来的问题中解救出来。然而，这一事件催化中苏联盟的崩溃。一位苏俄将军前往日本揭露中国行动背后的真相，结果惊奇地发现中国已经与太平洋阵线达成协议。这一事件标志着中苏联盟的结束。中国计划通过入侵俄罗斯来让自己成为苏维埃联盟的领导者。入侵一开始是成功的，中国设法摧毁了苏俄的最后两枚MIDAS洲际导弹，但最后他们被在库页岛被击退。
入侵的失败迫使中国退缩，给苏俄足够的时间来恢复。然而，这一事件使中国和太平洋阵线之间的同盟关系恶化，而这种同盟关系稍后在朝韩边界爆发冲突时破裂。苏俄被报道正在建造更多的MIDAS洲际导弹，虽然报告不尽真实，但苏俄的确在认真对待此事，来让他们至少能控制住世界。后来，一个意想不到的事件发生了：心灵军团进攻了列宁斯克航天区并偷走了苏俄的火箭技术来用于不明目的。这一事件最终使苏俄意识到，心灵部门的领导者尤里是所有这些的幕后黑手。尤里自己后来宣布成立了厄普西隆军，这是一支只有一个目标的部队：命令与征服人类的未来。
心灵终结战争的故事发生在两年后的1984。此时，苏联通过欺骗世界来相信他们仍然拥有MIDAS洲际弹道导弹，来确保他们的权力仍然至高无上。与此同时，在现在改名为苏维埃美利坚的美国内，民兵的反抗次数愈发减少，基本处于和平状态。一切似乎都按计划进行了...
尤里认为这是厄普西隆军以艰难的方式向全世界宣布他们的存在的最好时机。因此，他计划开展两项行动：对苏联在莫斯科的胜利游行发动攻击和接管改名为斯大林顿的华盛顿特区。
很快，盟军和苏联都会感受到厄普西隆军的愤怒。厄普西隆纪元即将开始，即将爆发被称为“心灵终结战争”的全球冲突。
剧情
在苏联进攻英国失败后，战争陷入了僵持状态。在此期间，盟苏之间的摩擦时有发生（盟军合作任务：均势、王牌铁骑；苏联合作任务：财源）。这段时间尤里也成功阻止了一名中国特工泄露有关苏俄MIDAS的真相，让苏俄保持了“强大”（厄普西隆附加任务：沉默是金）。
1984年9月1日，美国反抗军对华盛顿——此时已改名为斯大林顿，发动了大规模的反击。苏联指挥官成功抵挡了这次入侵（苏联13：暗鸦），但状况随后发生了转变：华盛顿迅速被一支不明军队攻陷，指挥官本人也失去了音讯。所幸驻守于斯大林顿的两名苏联上校雷泽诺夫和库可夫及时行动，指挥官被救出并逃离此地（苏联14：复苏）。尤里宣告回归了，他不仅突袭了华盛顿，还在同一天对苏俄的心脏莫斯科发起了袭击，夺走了苏俄的白杨M发射台，杀死了罗曼诺夫总理（厄普西隆13：征服者）。
趁着苏联指挥部陷入混乱的良机，盟军也开始了行动。9月5日，为了营救被关押在波兰华沙的谭雅，西格弗里德亲自使用了第一套超时空军团战斗服（盟军13：美人鱼）。厄普西隆部队也开始在欧洲行动。位于西班牙萨拉戈萨的克隆缸被尤里注入了基因病毒，拉恩以及大量的狂兽人被制造出来，吞没了这里的一切（厄普西隆14：狼群领袖），雷泽诺夫上校和库可夫上校前往调查，与幸存者摧毁了被污染的克隆缸，阻止了病毒蔓延（苏联合作任务：沉醉）。厄普西隆还在苏俄部队的反击下保护了位于罗马尼亚的科研设施，并研制出了心灵之主（厄普西隆15：记忆之主）。
尤里在罗马建设了一座心灵控制增幅器来调用龟缩在伦敦要塞里的盟军（厄普西隆合作任务：红衣主教）。为了不让心灵控制效果扩大至英国，谭雅和欧洲联盟部队发动了突袭（盟军14：傀儡师）。尤里计划暗杀一些阻碍他计划的人，其中就包括了莫拉莱斯。莫拉莱斯在里约热内卢发出求救信号，拉丁同盟的部队抵达后却发现这里已经遍布了厄普西隆的克隆缸。最终莫拉莱斯成功撤离，克隆缸也被摧毁（苏联15：逃出生天）。盟军对挪威的科研设施发起了反击，阻止厄普西隆部队窃取科技的行为，并夺回了梭鱼轰炸机的科技（盟军15：冷面狂人）。但在此期间，厄普西隆在德国回收了被苏联从黑森林取得的超时空传送仪初号机，为下一步行动做好了准备（厄普西隆16：十字路口）。
通过解放戛纳的军事行动（盟军附加任务：顽疾），盟军在摩洛哥又发现了一座处于天蝎组织控制之下的心灵控制增幅器，将其摧毁后却发现当地的美军不是受到了心灵控制，而是自愿加入厄普西隆的。增幅器和心灵信标只是为了调虎离山，引诱指挥官离开英国（盟军16：幽灵狩猎）。与此同时，利用第一代超时空传送仪，厄普西隆趁盟军部队出征摩洛哥的时候，将空中要塞伊利卡拉传送进了伦敦，想要给盟军致命一击。但是就在即将得手之际，盟军的秘密武器，悖论计划的成果——悖论引擎升空了，并使用时间静止瞬间摧毁了厄普西隆的入侵部队（厄普西隆17：天赐）。
随后，悖论引擎以及盟军主力部队迅速撤离。心灵军团包围了英国，并在锡利群岛部署了大量炼狱平台以击落悖论引擎。西格弗里德训练的第一批超时空军团兵加入了战斗，他们清除了炼狱平台，以使得悖论引擎可以成功通过（盟军17：瓶颈）。使用悖论引擎的时间静止，盟军对多个厄普西隆的非洲基地进行了打击。为了确保新武器的研发，天蝎组织在盟军的攻击下，成功将一些原型机转移至隧道中（厄普西隆18：生存本能）。悖论引擎在多次使用时间静止后，能量不足，盟军派出一支部队登上特内里费岛，抢夺了厄普西隆的生化反应室为悖论引擎充能（盟军18：歇斯底里）。
苏联也得知了尤里的心灵控制增幅器计划，并发现厄普西隆在被核爆夷为平地的芝加哥废墟上建立了增幅器。拉丁同盟的部队赶在了美国反抗军之前占领了这座增幅器（苏联16：赴汤蹈火）。厄普西隆则使用遍布美国的心灵信标来抵御增幅器，同时计划对苏联指挥官进行暗杀，但是失败了（厄普西隆合作任务：唯心主义）。美国反抗军也占领了一座心灵信标，厄普西隆部队前去摧毁它，并保护了正在开发中的心灵支配仪（厄普西隆合作任务：单色画）。
为了共同对付厄普西隆的威胁，苏俄和中国决定抛弃前嫌，在新加坡举行谈判。心灵军团部队和被控制的苏联部队企图阻止这次会议，但被中苏联军挫败（苏联17：主宰）。条约成功签订了，中国要求释放在中苏交战期间的战俘。苏俄同意了，但尤里则使用心灵控制进行破坏（苏联附加任务：杂音）。同时，拉恩的部队也袭击了菲律宾莱特湾的中苏联合基地，以探查他们成立的新联盟的情报（厄普西隆合作任务：隐喻）。得到的情报显示：1. 离港的中国太平洋舰队的目的地是托托亚岛 ，目的是阻止载有尤里投放的应对不利局势的“王牌”的空降舱的降落；2. 中国正在研发的新科技，尤里决定对研发这些科技的设施进行打击（厄普西隆合作任务：科技封锁），同时出兵克什米尔以调查这些科技的去向。
虽然挫败了尤里的计划，雷泽诺夫和库可夫却发现了中国的秘密计划：他们企图借助从沃尔科夫身上获得的数据来开发自己的半机械人军团（苏联合作任务：钢骨）。最终雷泽诺夫和库可夫在新疆摧毁了生产这些半机械人的纳米离心机（苏联18：心血结晶）。尤里投放的空降舱的着陆点托托亚岛被中国的太平洋舰队发现，并遭到了猛攻。心灵军团阻挡住了中国部队的进攻，直至空降舱降落。乘坐在空降舱里的“王牌”——天秤出场了，并消灭了中国部队（厄普西隆19：血舞）。
苏俄开始对中国独吞科技的行为产生了不信任。他们决定假装成被尤里心灵控制的军队，以夺取中国的科技秘密（苏联19：力量嗜欲）。但之后苏俄发现中国的新科技研发是由他们的科学家云茹主导的，而她已经研发出了强大的百夫长攻城机甲。拉丁同盟前往克什米尔绞杀云茹，而厄普西隆部队也已经抵达了那里。云茹自知自己敌不过强大的敌军，于是在敌人部队集结完毕前利用克什米尔的地下通道提前跑路，留下高音喇叭蒙骗敌人。拉丁同盟占领了云茹的中枢计算机，但随后克什米尔却毁于核爆——中国得到了在中苏交战期间被掩埋的最后一枚MIDAS弹头，这场爆炸杀死了莫拉莱斯以及各方的大量士兵（苏联20：惧之路）。
云茹在逃离苏军的围攻后，又被厄普西隆军队再次定位。天秤使用反重力场摧毁了百夫长攻城机甲，并奉命追击云茹，但后者使用EMP将天秤的CAS装置干扰，使其失去理智并进入暴走状态（厄普西隆20：机械首脑）。厄普西隆军队不得不在中国军队与云茹禁卫军的混战中回收暴走状态中的天秤（厄普西隆隐秘任务：血怒）。此时，云茹的计划也开始进行，新型人工智能沃克网也已上线。为了对抗真正的敌人尤里和其他原因，云茹的部队被迫脱离了中国，并成功协助云茹逃离克什米尔地区（焚风01：背井离乡）。厄普西隆继续进行追击，云茹则夺取了哈萨克斯坦舍甫琴柯堡的铁翼喷气机并安全离开（焚风02：亡命之徒）。
大西洋战线上，位于维尔京群岛的太平洋阵线部队为盟军提供了天气控制机，并与西格弗里德的部队合力击退了心灵军团和被控制的苏俄部队的进攻（盟军19：风暴使者）。此后位于圣胡安的美军部队向盟军大部队求救，太平洋阵线前去掩护这支美军部队撤离（盟军合作任务：低温）。尤里发现了拉什迪的背叛行径，似乎他与中国达成了协定。尤里本想用增幅器来控制天蝎组织，但是失败了，于是他迅速派出天秤和拉恩去斩草除根，剿灭拉什迪（厄普西隆21：黑曜石之海）。同时，厄普西隆还追查到了天蝎组织研发的神经毒素，并派出部队去摧毁其研发设施（厄普西隆合作任务：绝命毒师）。随着天蝎组织在比绍的大本营的毁灭，厄普西隆准备新建增幅器来控制残余的天蝎组织。
厄普西隆随后启动了位于亚马逊热带雨林的心灵控制增幅器，想要夺取天气控制机，他们还准备了两个核弹发射井。谭雅和友川纪夫被传送到那里，摧毁了发射井和增幅器（盟军20：偏执狂）。同时另一支盟军部队被派往安哥拉收集资源，他们在那里发现了心灵军团和天蝎组织之间的冲突（盟军附加任务：金属盛宴）。在亚马逊雨林的行动之后，来自圣胡安的美军和另一支来自悖论远征军的部队在巴西圣路易斯解除了对悖论引擎的第二次核威胁（盟军附加任务：交通管制）。由于在比绍重建心灵控制增幅器的计划受到了悖论引擎的破坏，拉恩被要求重启位于扎伊尔的最后一个增幅器，在那里他与当地的厄普西隆部队一起成功地控制了非洲天蝎组织剩余的反叛者（厄普西隆附加任务：夜行者） 。这一行动彻底打败了天蝎组织，但是马尔翁秘密地从利比亚的被心灵控制的天蝎组织基地中回收了神经毒素（厄普西隆附加任务：劫后余生）。
苏联借助中国的科技将遍布欧洲的卫星系统重新连接，定位了在瑞典雪地中的厄普西隆航天区，苏联占领了火箭发射台并将目标转向被发现的尤里月球基地（苏联21：熔毁）。盟军发现了一座位于开普敦的大型厄普西隆海军基地，而这里也是厄普西隆的联络枢纽。盟军集中了所有的剩余部队，对这里展开了大规模的进攻。最终这里的厄普西隆被击溃，而承载了大量情报的雷达旋塔也被盟军所占领（盟军21：毫不留情）。通过这些情报，盟军发现了尤里位于南极的最终基地。此时盟军已经所剩不多，而心灵军团又摧毁了悖论引擎的备用电池（厄普西隆合作任务：背刺）。盟军决定孤注一掷，让全军和悖论引擎向南极进发。在云茹逃离后，中国开始怀疑内部出现了叛徒，并封锁了所有被他们占领的金川工业设施以防止泄露。云茹只得亲自前往日本回收粒子撞击炮科技，并协助那里的太平洋阵线盟友对抗厄普西隆（焚风03：帝国飘摇）。这场战斗中获得的情报表明了各方的动向，距离尤里完成他计划的时间已所剩无几。日本的太平洋阵线部队也全部前往白令海峡以准备下一步行动。
借助悖论引擎的能力，盟军成功突破了南极洲的第一道防线（盟军22：极昼）。但前景不容乐观：尤里的终极武器正在干扰他们的通讯，悖论引擎也无法长时间支撑。盟军部队只得各自为战，向位于极点的厄普西隆核心基地推进......
云茹接到了盟军开始攻击厄普西隆在南极洲的总部的消息，并在白令海与拉什迪会合并开始进一步研究，但是大反抗军没能占领火箭发射台以完成逃往太空的目标（焚风04：大洋彼岸）。因此，为了远离厄普西隆总部的“终极武器”，他们只能尽可能一路向北移动以获得立足点......
苏军登陆月球一探究竟，并摧毁了厄普西隆的月球基地（苏联22：地出）。与此同时，厄普西隆的南极前线基地被盟军摧毁，但尤里的计划仍然没有准备完毕，他需要在之前夺取的超时空传送仪初号机里完成他的工作。异教不惜一切代价保护这座传送仪，但仍然不敌悖论引擎。尤里最终被传送回莫斯科，吸引苏军的注意。保护南极总部的重担交给了异教，天秤则在拉恩的护送下前往极点（厄普西隆22：晴天霹雳）。苏联获得了尤里就在莫斯科的消息，然后大多数留在地球上的部队对厄普西隆在俄罗斯的基地发动了几次袭击，恢复了天启坦克技术（苏联附加任务：破晓者）并摧毁了斯大林格勒的厄普西隆基地（苏联附加任务：战火兄弟连），而月球部队准备借助月球基地的全球打击能力对尤里本人发动总攻......
（心灵终结全剧情）宝，都看到这里了你确定不收藏一下？？
